W celu uniknięcia powielania kontrahentów w bazie podczas automatycznego księgowania dokumentów z plików zewnętrznych (np. z JPK) należy w oknie Konfiguracja -> Ustawienia ogólne -> Parametry -> Parametry księgowania z plików zewnętrznych zaznaczyć opcję Pomijaj myślniki w NIP przy sprawdzaniu kontrahenta.

Przy księgowaniu dokumentów z pliku JPK_FA zalecane jest również zaznaczenie opcji Usuwaj przedrostek PL z NIP-u kontrahenta odczytanego z pliku (JPK FA). Pozwoli to uniknąć zdublowania kontrahentów, którzy w księgowanym pliku JPK mają NIP z przedrostkiem PL, a w bazie wprowadzony jest NIP bez przedrostka.